邓华祥,1990年2月出生,男,副教授。主要从事基于IT(计算机科学技术)+BT(生物技术)开发食品益生菌高附加值化合物智能制造底盘、创制食品病原微生物药物与人类疾病药物等研究,已成功搭载 UniKP标准深度学习框架,实现食品相关酶的高精度挖掘与定向改造。
主持和参与了多项省部级项目,包括国家自然科学基金青年基金1项、中国博士后面上基金1项、江苏省青年基金1项、广东省基础与应用基础研究基金省市联合基金(粤深)项目1项、博士后留深资助项目1项、深圳先进院院优青1项。目前,在国际期刊上发表SCI论文30余篇。
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1.教育经历
2018.04-2019.04,加州大学伯克利分校,合成生物学,联合培养博士
2008.08 -2012.06,四川轻化工大学,生物技术,理学学士
2012.08-2019.06,江南大学,发酵工程,工学博士
2.工作经历
2024.07-至今,吉林大学,食品科学与工程学院,副教授
2021.06-2024.06,中国科学院深圳先进研究院,合成生物学,助理研究员
2019.06-2021.06,江南大学,食品科学与工程学院,博士后
3.社会及学术兼职
生物化学与分子生物学会员
4.主持或参加科研项目(课题)情况
国自然科学基金青年项目:竹红菌素合成漆酶的迭代定向进化及其催化机制解析,主持
深圳先进院院优青C类:基于自动化与机器学习技术合成黄酮类高附加值底盘微生物,主持
博士后留深资助项目:基于合成生物学技术构建黄酮类底盘,主持
江苏省青年基金:高产竹红菌素的氧化胁迫智能调控系统构建及机制解析,主持
中国博士后面上基金:高产竹红菌素底盘微生物的构建,主持
5.代表性学术论文
一作或通讯文章(†共同一作,*共同通讯)
Hu XX, Yan Y, Liu WJ, Liu J, Fan T-P, Deng HX*, Cai YJ*. Advances and perspectives on pharmacological activities and mechanisms of the monoterpene borneol. Phytomedicine 2024, 132: 155848. (共同通,IF=6.7,一区,)
Liu D, Gou LB, SunTT, Liu J, Fan T-P, Deng HX*, Cai YJ*. Characterization and application of a stationary phase promoter library from Serratia marcescens. ACS Synthetic Bioliogy 2024, 13(3): 969-972. (共同通讯,IF=4.7,中科院一区,)
Deng HX†,Yu H†, Deng YW, Qiu YL, Li FF, Wang XR, He JH, Liang WY, Lan YQ, Qiao LJ, Zhang ZY, Zhang YF, Keasling JD*, Luo XZ*. Pathway evolution through a bottlenecking-debottlenecking strategy and machine learning-aided flux balancing. Advanced Science. 2024, 11(14): e2306935. (第一作者,IF=15.1,一区)
Yu H†, Deng HX†, He J, Keasling JD, Luo XZ*. UniKP: a unified framework for the prediction of enzyme kinetic parameters. Nature Communications. 2023, 14(1): 8211. (共同一作,IF=16.6,一区,)
Deng HX*, Liang XX, Liu JB, Zheng XH, Fan T-P, Cai YJ*. Advances and perspectives on perylenequinone biosynthesis. Frontiers in Microbiology. 2022, 13: 1070110. (第一作者,IF=6.064,二区)
Deng HX*, Liang WY, Fan T-P, Zheng XH, Cai YJ*. Modular engineering of Shiraia bambusicola for hypocrellin production through an efficient CRISPR system. International Journal of Biological Macromolecules. 2020, 165(Pt A): 796-803. (第一作者,IF=6.953,一区)
Deng HX*, Bai YJ, Fan T-P, Zheng XH, Cai YJ*. Advanced strategy for metabolite exploration in filamentous fungi. Critical Reviews in Biotechnology. 2020, 40(2): 1-19. (第一作者,IF=8.429,一区)
Deng HX, Jia P, Jiang J, Bai Y, Fan T-P, Zheng X, Cai YJ*. Expression and characterisation of feruloyl esterases from Lactobacillus fermentum JN248 and release of ferulic acid from wheat bran. International Journal of Biological Macromolecules. 2019, 138: 272-277. (第一作者,IF=5.162,一区)