吉林大学食品质量与安全专业历史悠久，源于中国人民解放军兽医大学在1978年建立的兽医食品卫生检验专业。1984年兽医大学成立兽医食品卫生检验系，并成为该专业我国首批硕士学位授权点。1987年，被授予全军动物性食品检测中心，之后成为国家首批动物性食品卫生检验博士授予点。2004年，原中国人民解放军军需大学转隶更名为吉林大学农学部，军需工程系改名为军需科技学院，招收首批食品质量与安全专业本科学生。转隶后，依托吉林大学“211工程”和“985工程”学校平台，依托食品科学与工程一级学科博士授权点和吉林省高校“十二五”优势特色重点建设学科，食品质量与安全专业实现了跨越式的发展。2015年，吉林大学学科优化调整，原吉林大学生物与农业工程学院与军需科技学院相关专业合并形成新的吉林大学食品质量与安全系。
专业现有本科在校生260人，每年招生规模为90人左右，拥有专任教师24人，其中教授13人，副教授12人，讲师7人，13名专任教师具有海外留学经历。专业教师秉承食品卫生检验的专业特色，主要开展食品营养与安全检测、食品安全控制理论与技术、食源性致病菌天然抗菌剂的筛选及机制研究、食品安全与人体健康等4个方向的研究。
在人才培养方面，专业注重产教融合，探索“校企合作、协同育人”模式，以培养复合型人才为目标。同时，积极开展国际化教育，与意大利圣心大学开展3+2本硕连读项目，提升了学生的国际视野。
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